行为分析工具箱,依赖数据格式规范和埃博拉酱的图像处理工具箱
所有函数均在BehaviorAnalyze包下,使用前需导入:
import BehaviorAnalyze.*
将BehF1.0表读入为BehM1.0内存格式
输入参数:BehF10Paths(:,1)string,BehF1.0文件路径,默认打开文件选择对话框要求用户手动选择
返回值:BehM10,BehM1.0表
在BlinkM1.0表的Calendar子表中添加一列,记录本次实验的最终命中率
观察蓝光熄灭后、喷气之前的这段时间,最大的闭眼像素值;然后把蓝光亮和亮之前同样时间的像素值作为基线;如果响应窗像素值的最大值大于基线最大值,就认为是一次对蓝光的响应。这样将每个回合二元化,可以求得一个命中率。
BlinkM10(:,3)table,BlinkM1.0表,默认打开文件选择对话框要求用户手动选择包含此表的.mat文件
FrameRate(1,1)single=30,视频帧率
LightDuration(1,1)single=50,闪光的毫秒数
AirDelay(1,1)single=300,从闪光开始到喷气开始经过的毫秒数
ROI1Light(1,1)logical=true,指示是否Measurement矩阵第1行是Light而不是Eye曲线
BlinkM10(:,3)table,其Calendar子表添加了一列BlinkRates
将光闭眼视频的测量值作图,展示光、喷气、闭眼的时相关系
%选择BlinkM11数据表文件载入
BehaviorAnalyze.BlinkPlot(MATLAB.General.Load().SessionTable.Calendar{1}.Measurements{1});
%显示图窗,观察灯亮、闭眼、喷气三者的时相是否正确。
Measurements(2,:),第1行是眼睛测量值,第2行是灯光测量值
AirDelay(1,1),从光亮到喷气的延迟
FrameRate(1,1),视频帧率
从BlinkM1.1表生成平均值/标准误折线
[Mean,Sem]=BehaviorAnalyze.BlinkM11_MeanSemLine(BlinkM11);
BlinkM11(:,3)table,符合BlinkM1.1规范的数据表,必须具有Calendar.BlinkRates可选列
Mean(:,1)double,平均值折线 Sem(:,1)double,标准误折线
将BlinkM1.1表的Calendar.Measurements的每个矩阵的两行交换
BlinkM1.1表的Calendar.Measurements的每个矩阵的两行具有固定的意义,第1行是眼睛,第2行是灯。如果数据不慎搞反了,可以用本函数换回来。
输入参数:BlinkM11(:,3)table,待交换的BlinkM1.1表
返回值:BlinkM11(:,3)table,交换后的BlinkM1.1表
根据样本的均值和方差,生成一条对数正态分布曲线
Samples(:,1)numeric,样本值
Xs(1,:)numeric,分布曲线的横坐标
Curve(1,:)double,分布曲线的纵坐标
在尺寸不同的数组之间求分块平均值和总体标准误
尺寸不同的数组之间一般不能直接算平均值和总体标准误。将每个数组在其每个维度的起始端对齐,不足部分补0,求其平均值数组和总体标准误数组。其中N值取在该位置有实际值的数组个数,因此得到数组的不同位置具有不同的N值。对于向量,还支持分块操作,例如每5个Trial作为一个Block算平均和标准误
HeterogenousData cell,每个元胞里包含一个数组。将在不同元胞的数组之间求统计量,数组内部不作统计。
BlockSize(1,1)uint8=1,分块尺寸,将在块内求平均值和标准误。如果大于1,无论输入数组为何,输出数组都将为行向量。
Mean,平均值数组,各维尺寸为输入数组各维尺寸的最大值保证适配。
Sem,总体标准误数组,尺寸同Mean。
Number,上述两个统计量数组,其各元素的计算实际参与的数组个数。
统计时间表中命中和错失的数目
TimeTable tabular,必需,可以是普通表或时间表
HitTag(1,1)string="命中",可选,表示命中的时间表事件标签
MissTag(1,1)string="错失",可选,表示错失的时间表事件标签
HMVector(:,1)logical,命中向量,列出具体的每个回合是否命中
NoHits(1,1)double,命中的次数
NoMiss(1,1)double,错失的次数
批量测量光闭眼实验视频
本函数的输入参数和ImageProcessing.VideoBatchMeasure完全相同,主要是增加了额外任务特定功能:解析视频文件的规范文件名
<鼠名>.<实验日期>.<会话名>.mp4
然后和测量值一起组合成BlinkM1.1格式数据表,保存到视频所在目录下,命名为BlinkM11.mat
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