# bam2img

**Repository Path**: biomed/bam2img

## Basic Information

- **Project Name**: bam2img
- **Description**: 对BAM文件截图
- **Primary Language**: Unknown
- **License**: MIT
- **Default Branch**: master
- **Homepage**: None
- **GVP Project**: No

## Statistics

- **Stars**: 0
- **Forks**: 0
- **Created**: 2021-12-02
- **Last Updated**: 2024-01-16

## Categories & Tags

**Categories**: Uncategorized

**Tags**: None

## README

# BAM shot

该包用于对BAM文件画图，依赖samtools, python3.X, pyssam版本： 主要参数:

- bam: BAM文件
- ref: 参考基因组FASTA，需要提前使用samtools faidx构建索引
- chrom: 染色体
- start: 起始位置
- end：终止位置
- extend：两端拓展长度
- ……