版本提交记录

2018-1-3

项目启动，主要是文字方面的一些构想。

2019-3-11 1.0.0版, Commit:Go frog go!

开发环境完成，演示第一个人工生命诞生。但是所有Frog脑部为空，因为运动神经元被短路，只能固定向一个方向运动。
这是第一个发布版，演示了生命的随机进化和优胜劣汰。

2019-3-18, Commit:Brain picture!

添加了脑结构图形，用于调试用，可以显示第一个胜出的Frog的脑结构，但是运动神经元依然被短路，只能固定向一个方向运动。
有了脑结构图，就可以防止所有Frog都被淘汰掉，还不知道问题发生在哪里。可以有针对性地改进进化算法、环境的参数改进。

2019-03-20, 1.0.1版, Commit:Add a button

添加了一个按钮，可以显示、隐藏第一个胜出的Frog的脑结构图，但是运动神经元依然被短路

2019-03-21, 1.0.2版, Commit:I'm hungry

在脑区添加Hungry，删除随机运动的硬编码，改成由Hungry区来驱动，一旦frog能量小于10000,hungry区的所有脑神经元的input区激活，如果这些神经元的输出区位于move区，则作相应的移动。这是一个更随机一点的运动，不再总是固定向一个方向。

2019-03-27, 1.0.3版, Commit:Shrink & Sperm

添加了"卵+精子->受精卵"的模拟，这是为了实现生物多样性。添加了每次添加一批随机神经元，但是只保留激活过的，如果某组神经元从没被用到(激活过)，则有很大的可能不会将这组神经元添加到蛋中(用进废退规则)。

2019-03-29, Commit:Rainbow

更正一个小Bug,BrainStructure的zone显示的半径是实际的一半，用彩虹色而不是随机数来表示CellGroup的细胞数量，色彩越靠后表示细胞数越多。

2019-04-01, Commit:Cleanup

做一些debug清理,每个Frog不再保留egg的副本，“卵+精子->受精卵”算法改进一下，不能简单两两相加，而是随机取一个精子的cellgroup。

2019-04-06, Commit:Windows align

还是做一些清理, 可以自由调整虚拟环境、脑图的显示大小。下面的打算是将mouth、leg、hungry等区移到蛋里去，允许进化，而不是作为Frog的硬编码存在。

2019-04-07, Commit:Organ

引入Organ类，将mouth、leg、hungry等作为Organ器官移到蛋里去，而不是作为Frog的硬编码存在，这样架构更清晰，而且便于以后将Organ参与遗传、变异、进化。

2019-04-08, Commit:Eye shortcut

添加眼睛，能够看到四个正方向的食物，但是自然选择的结果是眼睛和移动区短路了，眼睛起的作用并不大，因为如果有两个方向同时出现食物，目前青蛙是不能判断的。 下面要考虑逻辑了，也就是思考判断能力（后天条件反射的建立)。

2019-04-12, Commit:Random frog

没做大改动，只是将青蛙改成按整个地图随机分布，看起来眼睛的作用就比较明显了，比起随机运动，明显食物被吃掉更多。

2019-05-23, Commit:2 eyes no helps

没做大改动，只是演示添加两个眼睛后，对它的进化没有帮助，到此为此，逐渐看出问题了，没有记忆能力和模式识别能力。目前存在两个比较大的硬编码，导致它不能进一步进化：1.用CellGroup这种硬编码方式，导致在Frog的生存期不能产生记忆功能，而需要多次淘汰，这不符合现实中青蛙从小学到大这样的实际过程，它不需要死很多次。另一个问题是眼睛部分存在硬编码，因此只能起到感光作用，但是不具备根据外在图像进行模式识别能力。所以下面要开始进行非常大的结构改进，。将把CellGroup作为器官引入，但是它的内部细胞是动态生成的，而且不是随机生成的，而是任两个细胞在它的区内活跃就生成新的细胞(将来也可以参与新建细胞)。CellGroup的数量、大小、网格密度（直接影响到神经元生成多少和算法快慢)会参与遗传和进化，快乐和痛苦器官会对新细胞生成的类型有影响。fat参数用来指示它的肥胖度。Fat高的遗传时会保留，并可能变大、变小、内部允行连接数更多、分化成更多CellGroup，但是它的内部连接(新建的细胞)不会参与遗传，这样每个个体都出生时都是一张白纸，虽然也许CellGroup已经进化得很多层很复杂。同一个位置可以存在多个CellGroup,这样由多层大小、位置不同的Layer就同时具备了模式识别和记忆功能，而且这个算法比较简单，很好理解。大范围的Cellgroup可以解释条件反射的形成（两件不相干的事之间形成联系)，小范围的Cellgroup可以解释模式识别（相邻感光细胞同时激活，经过层层处理后，汇总到最上层的某个Cellgroup的激活)。而所有这些CellGroup的形成(结构和层级)都可以用非常简单的"用进废退"规则(Fat值控制遗传、随机变异和适者生存来探索最优解)来最终进化出来。

2019-06-13, Commit: Happy & Pain

主要做了一些清理,将所有器官移到单独的类里，删除OrganDesc类。将一些类(如Applicaton移到根包下)移到不同的包下。这个版本是比较大的一个重构，最大的进步是将算法当成一个器官引入，当然，这个版本只存在一个随机连接两端的算法，以后会扩充。 另外，顺手加上了Happy和Pain两个器官，分别对应进食愉快感和痛苦感，后者在靠近边界时激发。观查它的表现，果然不出所料，痛苦感立即生效，有一些Frog移动到边界后就不再前进，而是顺着边界溜下去了，不傻，但是Happy器官没有生效，这也很显然，因为Happy属于进食反射链的一部分，在没有记忆器官（算法）引入之前，是没有途径使用上进食奖励信号的。