# gmx

**Repository Path**: chenbq479/gmx

## Basic Information

- **Project Name**: gmx
- **Description**: molecular dynamics simulation and analysis. 分子动力学模拟和分析。
- **Primary Language**: Unknown
- **License**: Not specified
- **Default Branch**: master
- **Homepage**: None
- **GVP Project**: No

## Statistics

- **Stars**: 0
- **Forks**: 0
- **Created**: 2021-12-17
- **Last Updated**: 2021-12-17

## Categories & Tags

**Categories**: Uncategorized

**Tags**: None

## README

# Gromacs模拟协议、轨迹分析、测试分析

## Gromacs相关
1. 安装笔记[gmx_install.sh](./gmx_install.sh)
2. 模拟脚本[gmx_mpi.sh](./gmx_mpi.sh)
3. 模拟设置mdp文件[gmx_mdp_files](./gmx_mdp_files)
4. 轨迹分析[trajectory_analysis_by_Gromacs](./trajectory_analysis_by_Gromacs.md)

## 笔记
1. [李毅笔记](./notes/李毅笔记.md)
2. [梁晶步骤](./notes/梁晶步骤.txt)
3. [杜星笔记](./notes/杜星笔记)
3. [元动力学](./notes/metadynamics.md)

## 小技巧
1. linux相关[linux.md](./tips/linux.md)
2. gnuplot绘图技巧[gnuplot.md](./tips/gnuplot.md)
3. openmm安装[openmm.md](./tips/openmm.md)