# 理论与计算化学教程

**Repository Path**: yuze-hao/computationalchem

## Basic Information

- **Project Name**: 理论与计算化学教程
- **Description**: 一个化学系本科生在计算化学课题组的工作学习总结
这篇教程既作为对初学者的教程也作为题主自己的笔记
- **Primary Language**: Unknown
- **License**: Not specified
- **Default Branch**: master
- **Homepage**: None
- **GVP Project**: No

## Statistics

- **Stars**: 0
- **Forks**: 0
- **Created**: 2024-01-18
- **Last Updated**: 2024-01-18

## Categories & Tags

**Categories**: Uncategorized

**Tags**: None

## README

# 理论与计算化学教程

#### 介绍
这是一个化学系本科生在计算化学实验室的工作学习总结
这篇教程既作为对初学者的教程也作为题主自己的笔记
这篇教程主要为化学系本科生作为入门并进阶的计算化学以及AI4Science的教程，主要涉及到DFT,MD计算以及机器学习以及深度学习算法。
同时也可作为计算凝聚态物理以及计算材料学的教材使用。

#### 目录
1. 计算机基础
 1.1 linux命令行操作
 1.2 Git
 1.3 notebook
 1.4 markdown&LaTeX
2. 常用编程语言
 2.1 python
  2.1.1 基本语法
  2.1.2 常用机器学习与深度学习库
   2.1.2.1 Sklearn
   2.1.2.2 pytorch
   2.1.2.3 keras
 2.2 Fortran
 2.3 MATLAB
 2.4 Julia
3. 机器学习算法
 3.1 回归
  3.1.1 最小二乘法
  3.1.2 SISSO
 3.2 支持向量机
 3.3 决策树
 3.4 K-means算法
 3.5 随机森林算法
 3.6 朴素贝叶斯
 3.7 混合高斯算法
4. 深度学习算法
 4.1 AI4S简介
 4.2 多层感知机（MLP）
  4.2.1 感知机
  4.2.2 MLP实现
  4.2.3 正则化算法
 4.2 卷积神经网络（CNN）
  4.2.1 卷积层及池化层
  4.2.2 残差神经网络(ResNet)
 4.3 RNN\LSTM
  4.3.1 RNN实现
  4.3.2 LSTM实现
  4.3.3 符号回归神经网络
 4.4 图神经网络（GNN）
 4.5 Transformer
  4.5.1 基本实现
  4.5.2 注意力机制
 4.6 混合专家模型(MoE)
 4.7 调参策略
5. 分子动力学模拟(MD)
 5.1 lammps
 5.2 DeePMD
6. 量子化学计算
 6.1 VASP
 6.2 Hartree-Fork理论
 6.3 后HF计算
 6.4 密度泛函理论计算（DFT）
7. 计算量子力学
 7.1 本征态，本征向量与本征函数
 7.2 薛定谔方程的数值解
  7.2.1 一维情况
  7.2.2 二维情况
 7.3 一维波函数的演化
 7.4 一维势垒贯穿
8. 量子计算
 8.1 量子比特
 8.2 量子门
 8.3 QISKIT
9. 偏微分方程（PDE）
 9.1 数值解
 9.2 PINN
10. GPU并行计算
 


#### 安装教程

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#### 使用说明

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#### 参与贡献

1.  Fork 本仓库
2.  新建 Feat_xxx 分支
3.  提交代码
4.  新建 Pull Request


#### 特技

1.  使用 Readme\_XXX.md 来支持不同的语言，例如 Readme\_en.md, Readme\_zh.md
2.  Gitee 官方博客 [blog.gitee.com](https://blog.gitee.com)
3.  你可以 [https://gitee.com/explore](https://gitee.com/explore) 这个地址来了解 Gitee 上的优秀开源项目
4.  [GVP](https://gitee.com/gvp) 全称是 Gitee 最有价值开源项目，是综合评定出的优秀开源项目
5.  Gitee 官方提供的使用手册 [https://gitee.com/help](https://gitee.com/help)
6.  Gitee 封面人物是一档用来展示 Gitee 会员风采的栏目 [https://gitee.com/gitee-stars/](https://gitee.com/gitee-stars/)