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纯粹出于兴趣,纯粹的随便写写。

Python
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    coding playground/PyPDA

    PyPDA是一个集成了蛋白质序列分析、PDB文件处理和UniProt数据检索功能的综合工具,旨在为生物信息学研究提供便捷的蛋白质数据分析解决方案。

    coding playground/CellAUC

    CellAUC 是一个专为评价化合物抑制细胞系活性而设计的Python分析工具包。它基于曲线下面积(AUC)方法,可处理时间依赖性和剂量依赖性细胞实验数据,提供全面的统计分析和高质量可视化功能。

    coding playground/PyBIP

    Python Boltz/Protenix Input Generator 是一个Python脚本,旨在简化为生物信息学工具 Boltz-2 (输出YAML格式) 和 Protenix (输出JSON格式) 生成输入文件的过程。它能够解析FASTA格式的蛋白质、DNA、RNA序列文件,CCD配体信息,以及包含化合物ID和SMILES的CSV文件,然后生成相应的结构化输入文件。

    coding playground/VeritasGene

    VeritasGene是一个整合了OpenTargets和PubMed查询功能的检索工具集,可以帮助研究人员快速获取基因、疾病和药物相关的信息。

    coding playground/TomurAUC

    TumorAUC是一个专业的肿瘤生长动力学分析工具,使用曲线下面积(AUC)方法来量化和比较实验动物中肿瘤生长的动力学特征。该工具基于Duan等人(2012)的方法,可处理删失数据,并生成高质量的统计分析和可视化结果。

    coding playground/grouping

    这是一个用于动物模型实验中自动分组的工具,能够根据动物的体重、肿瘤体积等指标,使用模拟退火算法实现均衡分组,确保各组之间的差异最小化。

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