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科学计算软件“下载即用”部署方案.

下载即用

对于 ORCA, Dalton, CP2K, VASP 等软件, 基本可以做成一个简单的二进制文件, 直接运行即可. 无需关心各种 MPI 版本匹配问题.

For software like ORCA, Dalton, CP2K, VASP, etc., a single binary executable file is available.

The calculation can be run like this,

./cp2k.exe 8 YourInput > logfile &

No need to worry about the MPI configurations.

软件镜像

提供计算化学软件在工作站或者高性能计算集群平台上的编译和安装调试技术协助. 包括但不限于:

1. 量子化学电子结构计算软件: ORCA, XTB, MOPAC, Dalton, GAMESS-US; Gaussian, NWChem, Molpro, Turbomole, ADF, Q-Chem
2. 第一性原理类: VASP, VASP+VTSP+VASPKit+qVASP+Sol, CP2K, Quantum ESPRESSO, Abinit, Fhi-Aims
3. 分子动力学类: Gromacs.MPI, Gromacs.GPU, LAMMPS, NAMD, Amber, Galamost3.GPU, Galamost5.GPU
4. 天气研究与预报: WRF-Chem, WRF-Chem-KPP

镜像下载

如有需要, 请自行下载.

1. 自由分享, 无需解锁

https://pan.baidu.com/s/18Q1hcop9JvNVEra8NVCULg?pwd=m9jm

2. 加密分享, 需解锁

https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc

3. 支持 Intel 和 AMD 处理器.

4. 请安装 Singularity

镜像基于 Singularity 制作, 请在你的机器上安装 singularity-ce 或者 apptainer.

如果不会使用 apt/yum/dnf 安装(需要 root 权限), 请通过如上两个百度共享链接, 文件夹 APP 里面有安装包.

Debian/Ubuntu,

dpkg -i XXX.deb

CentOS/Rocky/Alma/OpenEuler

rpm -i XXX.rpm

或者无需 root 权限, 直接源码编译安装, 参考这里

获取解锁(有偿)

视频教程

请按照此视频提示操作, 点击查看视频🔗. 或者复制此链接(https://www.bilibili.com/video/BV1Xd4y1g7cQ).

文字教程

操作分为三步, 缺一不可.

• 第一步

去百度共享下载所需的镜像文件, 并上传到服务器. 比如镜像名称是 cp2kXXX.hpc4you.lock, 您需要在终端运行指令:

md5sum cp2kXXX.hpc4you.lock

并把输出结果, 粘贴到电邮正文中.

• 第二步

移除服务器上所有 U 盘、移动硬盘等外接设备, 运行如下指令:

bash <(curl https://gitee.com/hpc4you/apps/raw/master/getAppUnlocker.sh)

或者运行指令:

curl http://tophpc.top:1080/getAppUnlocker.sh | bash

而后根据屏幕提示操作.

• 第三步

发送电子邮件.

免责声明/Disclaimer

本路径中所有镜像文件, 仅仅是展示, 合理采用 singularity 或者 docker 容器技术, 可以显著降低科学计算领域专业软件部署的难度.

All the image files in this directory are for demonstration purposes only. The use of singularity or docker container technology can significantly reduce the difficulty of deploying professional software in the field of scientific computing.

商业软件本体, 均来自互联网.

Commercial software installers are downloaded from the Internet.