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MindSpore / community

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【MindSpore开源实习任务】ESMFold模型迁移

TODO
Intern 成员
创建于  
2023-05-25 10:25

【任务分值】 30
【背景描述】
通过序列推理结构,迁移代码esmfold,esm2代码已上库,迁移结构部分内容
【需求描述】
esmfold模型迁移,基于GPU跑通推理,并完成正确性验证
代码地址:https://colab.research.google.com/github/sokrypton/ColabFold/blob/main/ESMFold.ipynb
论文地址:https://doi.org/10.1101/2022.07.20.500902
【环境要求】

  • 硬件: GPU
  • 软件: python

【编程语言】
python
【产出标准】
完成推理,并对齐精度,满足代码合入标准并合入MindSPONGE主仓,代码功能可以通过门禁检查并可以本地复现
【PR提交地址】
https://gitee.com/mindspore/mindscience/pulls
【期望完成时间】
2023-10-1
【开发指导】
MindSpore官网文档: https://www.mindspore.cn/tutorials/zh-CN/master/index.html
MindSponge主页及案例: https://gitee.com/mindspore/mindscience/tree/master/MindSPONGE/
【导师及邮箱】
chenmengyun1@huawei.com

本issue为面向高校学生的“MindSpore开源实习”项目的任务,非参加该项目的人员勿领。


【Task score】
【Background description】
【Requirements】
【Development environment】

  • Hardware:
  • Software:

【Programming language】
【Acceptance criteria】
【PR Submission address】
【Expected completion time】
【Development guide】
【Tutor & email】

Note: This issue is intended for the MindSpore open source internship project for college students. Developers who do not participate in this project are not allowed to receive it.

评论 (12)

melody 创建了Intern
i-robot 添加了
 
intern
标签
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Please assign maintainer to check this issue.
请为此issue分配处理人。
@melody

Please add labels (comp or sig), also you can visit https://gitee.com/mindspore/community/blob/master/sigs/dx/docs/labels.md to find more.
为了让代码尽快被审核,请您为Pull Request打上 组件(comp)或兴趣组(sig) 标签,打上标签的PR可直接推送给责任人进行审核。
更多的标签可以查看https://gitee.com/mindspore/community/blob/master/sigs/dx/docs/labels.md
以组件相关代码提交为例,如果你提交的是data组件代码,你可以这样评论:
//comp/data
当然你也可以邀请data SIG组来审核代码,可以这样写:
//sig/data
另外你还可以给这个PR标记类型,例如是bugfix或者是特性需求:
//kind/bug or //kind/feature
恭喜你,你已经学会了使用命令来打标签,接下来就在下面的评论里打上标签吧!

melody 修改了描述
melody 修改了描述

@mengke2023 , 感谢您认领此任务, 请及时跟导师沟通, 导师审核通过后才能承担此任务, 否则任务无效.

i-robot 移除了
 
intern
标签
i-robot 添加了
 
intern
标签
i-robot 添加了
 
intern-task-assign
标签

/intern-approve

@melody , 已报名认证过的导师, 才能审核任务, 谢谢!

/intern-approve

@melody , 已报名认证过的导师, 才能审核任务, 谢谢!

/intern-approve

@mengke2023 , 恭喜您已成功领取该任务, 请及时处理任务. 认领任务>导师审核认领资格>处理任务>提交任务>导师审核>pr合入>获得积分.

i-robot 移除了
 
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i-robot 移除了
 
intern-task-assign
标签
i-robot 添加了
 
intern
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i-robot 添加了
 
intern-task-assigned
标签

@mengke2023 , 您已取消此任务认领.

i-robot 移除了
 
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i-robot 移除了
 
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状态
负责人
项目
里程碑
Pull Requests
关联的 Pull Requests 被合并后可能会关闭此 issue
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开始日期   -   截止日期
-
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优先级
预计工期 (小时)
参与者(3)
1
https://gitee.com/mindspore/community.git
git@gitee.com:mindspore/community.git
mindspore
community
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